Para la fase de diagnóstico, la estructura del PEPH fue la siguiente:

 

diagramaGobernanzaFaseDiagnostico

En la fase de planificación estratégica la nueva gobernanza del PEPH es la siguiente:

 

diagramaGobernanzaFasePlanificacion

Para las funciones de secretaría y asistencia técnica de la Comisión General, asistirán a las mismas, con voz pero sin voto, representantes de la Oficina del Plan Estratégico de la Provincia de Huelva que se creará al efecto.